Inaugurato nel 1915, il museo ha sede nella casa natale di Giuseppe Mazzini dal 1934. Conserva un ricco patrimonio storico e artistico del Risorgimento, con figure come Mazzini, Garibaldi e Mameli. Il percorso espositivo copre dal 1746 alla Liberazione.

Il Museo di Pegli, ospitato in Villa Durazzo Pallavicini, è il più importante museo archeologico della Liguria. Inaugurato nel 1936, possiede oltre 50.000 reperti che raccontano la storia di più di centomila anni, dalla preistoria all’età antica.

Il Museo di Sant’Agostino valorizza opere dall’Antichità al XIX secolo che costituiscono, in un certo senso, l’archivio monumentale della città e offre visite guidate ai depositi dove sono conservati i resti di monumenti della città.

Nato nel 1867, quello di Storia Naturale è il più antico museo della città e possiede collezioni scientifiche con 4,5 milioni di reperti. Espone 6.000 esemplari, tra cui mammiferi, vertebrati, insetti, minerali e una cellula ingrandita 100.000 volte.

Il Museo di Arte Contemporanea di Genova Villa Croce, inaugurato nel 1985, è ospitato in una villa ottocentesca affacciata sul mare a Carignano. Possiede oltre 4.000 opere d'arte moderna e contemporanea, con una programmazione annuale di mostre ed eventi.

Nel parco di Villetta Di Negro si trova un edificio razionalista progettato da Mario Labò per custodire la collezione d'arte giapponese donata da Edoardo Chiossone. Il museo, fondato nel 1905, conserva la più grande collezione d'arte nipponica in Italia.